Untuk mewujudkan visi tersebut, maka misi yang akan dilakukan adalah sebagai berikut :

1. Melayani Masyarakat dengan sepenuh hati;
2. menyelenggarakan Pemerintah yang amanah bersih dari korupsi dan Interpensi;
3. Mengoptimalkan penggunaan asset-asset Desa untuk dikelola agar lebih Baik;
4. Selalu melibatkan Tokoh masyarakat dan pemuka Agama dalam bermusyawarah;
5. Membangun mental spiritual bagi seluruh birokrasi dan masyarakat untuk mewujudkan Desa Stagen yang religious dan bermartabat;